La etapa de modelado consiste en ir dando forma a objetos individuales para luego poder imprimirlos.
En el modelado 3D se incluye una amplísima gama de herramientas a muy diferentes niveles, con usos y aplicaciones que van desde lo biomédico hasta el cine, pasando por la arquitectura, la ingeniería, los videojuegos o la ciencia. Desde clásicos de toda la vida como AutoCAD, hasta programas de código abierto como Blender, pasando por herramientas gratuitas de uso relativamente sencillo. La disponibilidad de software de modelado tridimensional sencillo y accesible es una de las piezas fundamentales en este ecosistema.
3D Software